16 червня 2023 року в Костромі під головуванням протоієрея Николая Несмєлова відбувся церковний суд у справі священика Іоанна Бурдіна. Про це написав журналіст і церковно-громадський діяч Сергій Чапнін.

Ієромонах Никон (Касярум), секретар суду, озвучив три пункти звинувачення:
1) заперечення святості і рятівних сил реальної історичної Помісної Церкви (Руської Православної Церкви), як наслідок, заперечення єдності зі святою Кафоличною Христовою Церквою (Мф. 16:18);
2) неприйняття Соборної дії Церкви з канонізації святих і сумнів у святості деяких святих (святої блаженної Матрони Московської, святого благовірного князя Димитрія Донського та ін.), що користуються загальним шануванням;
3) діяльність, що сіє недовіру до Церкви в середовищі віруючих, і як наслідок, спрямована на відторгнення віруючих від Христової Церкви.

За словами Чапніна, церковний суд “запропонував архієрею винести мінімальне за нинішніх часів покарання – заборонити отця Іоанна в служінні до”принесення покаяння”.