Філарет Денисенко видав указ, в якому він забороняє в служінні ректора Богословської Академії ПЦУ Олександра Трофимлюка. Документ надрукований на офіційному бланку УПЦ КП і опублікований на ресурсі cerkva.info, котрий лишається офіційним сайтом Київського патріархату.
«За порушення присяги священика, зокрема, “… буду здійснювати служіння згідно … вказівками духовного керівництва … У справі мого служіння мати в думках не особисту користь, але діло Боже, благо своєї Української Православної Церкви Київського Патріархату”, протоієрей Олександр Трофимлюк забороняється в священнослужінні», – сказано в тексті документу.
Сам Трофимлюк встиг прокоментувати указ і заявив, що з забороною не згоден і підкорятися Філарету не збирається.
«Об’єктивно не існує релігійного об’єднання під назвою «Українська Православна Церква Київського Патріархату». Відповідно до цього, як клірик Української Православної Церкви (Православної Церкви України) будь-які розпорядження, опубліковані від імені УПЦ КП, вважаю недійсними».
Олександр Трофимлюк, який зробив стрімку кар’єру в УПЦ КП, професійним зльотом повністю зобов’язаний Філарету.
У 2005 році Філарет «висвятив» його в «диякони», в 2007 – в «священики» УПЦ КП. З 2006 року Трофимлюк став главою прес-центру Київської Патріархії УПЦ КП і адміністратором офіційного сайту Київського Патріархату.
З 2011 він – проректор богословської академії УПЦ КП, Головний редактор журналу «Православний вісник».
З 2012 – глава видавничого відділу УПЦ КП. З 2013 року – перший ректор Богословської академії УПЦ КП, з 2014 – професор.
5 лютого 2019 Трофимлюк став ректором Академії. Також Філарет нагородив Олександра Трофимлюка безліччю орденів.
Раніше ієрарх ПЦУ Іоасаф Шибаєв заявив, що в процесі створення ПЦУ молода частина «єпископату» увійшла в союз з греками, протиставила себе старшим «архієреям» і розробила план з усунення Філарета.